MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 49592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012632	TATT	2	8	523	530	25 %	75 %	0 %	0 %	229583574
2	NC_012632	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583574
3	NC_012632	TAT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583574
4	NC_012632	ATT	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583574
5	NC_012632	GTT	2	6	637	642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583574
6	NC_012632	GTT	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583574
7	NC_012632	CTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583574
8	NC_012632	TTAC	2	8	698	705	25 %	50 %	0 %	25 %	229583574
9	NC_012632	GGT	2	6	864	869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583575
10	NC_012632	A	6	6	884	889	100 %	0 %	0 %	0 %	229583575
11	NC_012632	AG	3	6	939	944	50 %	0 %	50 %	0 %	229583575
12	NC_012632	TGC	2	6	959	964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583575
13	NC_012632	GTAA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	229583575
14	NC_012632	GAG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583575
15	NC_012632	ATGAGG	2	12	1087	1098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	229583575
16	NC_012632	TGG	2	6	1142	1147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583575
17	NC_012632	TAT	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583575
18	NC_012632	GATAA	2	10	1236	1245	60 %	20 %	20 %	0 %	229583575
19	NC_012632	ATA	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
20	NC_012632	AGAGG	2	10	1306	1315	40 %	0 %	60 %	0 %	229583575
21	NC_012632	AT	3	6	1357	1362	50 %	50 %	0 %	0 %	229583575
22	NC_012632	TTA	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583575
23	NC_012632	ATC	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583575
24	NC_012632	ACG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583575
25	NC_012632	AAC	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583575
26	NC_012632	TAA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
27	NC_012632	ATG	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583575
28	NC_012632	AGC	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583575
29	NC_012632	AGCT	2	8	1615	1622	25 %	25 %	25 %	25 %	229583575
30	NC_012632	G	6	6	1629	1634	0 %	0 %	100 %	0 %	229583575
31	NC_012632	AG	3	6	1682	1687	50 %	0 %	50 %	0 %	229583575
32	NC_012632	CCTT	2	8	1709	1716	0 %	50 %	0 %	50 %	229583575
33	NC_012632	AAG	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
34	NC_012632	AGA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
35	NC_012632	TAA	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
36	NC_012632	CAAA	2	8	1805	1812	75 %	0 %	0 %	25 %	229583575
37	NC_012632	AGA	2	6	1827	1832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
38	NC_012632	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583575
39	NC_012632	TGG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583575
40	NC_012632	AAG	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583575
41	NC_012632	GTATTG	2	12	1981	1992	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229583575
42	NC_012632	TGA	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583575
43	NC_012632	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
44	NC_012632	AGA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
45	NC_012632	CTA	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583576
46	NC_012632	GGA	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583576
47	NC_012632	AAG	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
48	NC_012632	AT	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	229583576
49	NC_012632	AAG	3	9	2238	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
50	NC_012632	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
51	NC_012632	AAG	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583576
52	NC_012632	ATT	2	6	2287	2292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583576
53	NC_012632	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583576
54	NC_012632	ATT	2	6	2318	2323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583576
55	NC_012632	ATA	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
56	NC_012632	TAT	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583577
57	NC_012632	TAA	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
58	NC_012632	TAA	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
59	NC_012632	TA	3	6	2518	2523	50 %	50 %	0 %	0 %	229583577
60	NC_012632	TAGG	2	8	2561	2568	25 %	25 %	50 %	0 %	229583577
61	NC_012632	AGA	2	6	2577	2582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583577
62	NC_012632	CTTT	2	8	2659	2666	0 %	75 %	0 %	25 %	229583577
63	NC_012632	AGC	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583577
64	NC_012632	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583577
65	NC_012632	GAT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583577
66	NC_012632	TAA	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
67	NC_012632	TGC	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583577
68	NC_012632	AAT	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
69	NC_012632	TGC	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583577
70	NC_012632	GCA	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583577
71	NC_012632	TGAT	2	8	2984	2991	25 %	50 %	25 %	0 %	229583577
72	NC_012632	TA	3	6	3064	3069	50 %	50 %	0 %	0 %	229583577
73	NC_012632	TAC	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583577
74	NC_012632	AATTGC	2	12	3081	3092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229583577
75	NC_012632	AAT	2	6	3126	3131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583577
76	NC_012632	GGTT	2	8	3323	3330	0 %	50 %	50 %	0 %	229583578
77	NC_012632	GAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583578
78	NC_012632	AAG	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583578
79	NC_012632	TTTAAG	2	12	3365	3376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229583578
80	NC_012632	CAAT	2	8	3386	3393	50 %	25 %	0 %	25 %	229583578
81	NC_012632	ATC	3	9	3435	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583578
82	NC_012632	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583578
83	NC_012632	AAC	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583578
84	NC_012632	GGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583578
85	NC_012632	TGA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583578
86	NC_012632	AAG	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583579
87	NC_012632	AGAA	2	8	3655	3662	75 %	0 %	25 %	0 %	229583579
88	NC_012632	CCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583579
89	NC_012632	TTTA	2	8	3696	3703	25 %	75 %	0 %	0 %	229583579
90	NC_012632	TCC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583579
91	NC_012632	TCCTT	2	10	3843	3852	0 %	60 %	0 %	40 %	229583579
92	NC_012632	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583579
93	NC_012632	ACTA	2	8	3921	3928	50 %	25 %	0 %	25 %	229583579
94	NC_012632	TTG	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583579
95	NC_012632	TAT	3	9	3954	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583579
96	NC_012632	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	229583579
97	NC_012632	A	6	6	3976	3981	100 %	0 %	0 %	0 %	229583579
98	NC_012632	TAA	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583579
99	NC_012632	TAG	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583579
100	NC_012632	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	229583579
101	NC_012632	CGTTA	2	10	4086	4095	20 %	40 %	20 %	20 %	229583579
102	NC_012632	T	6	6	4142	4147	0 %	100 %	0 %	0 %	229583579
103	NC_012632	TCC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583579
104	NC_012632	CTT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583579
105	NC_012632	CATT	2	8	4221	4228	25 %	50 %	0 %	25 %	229583579
106	NC_012632	TC	3	6	4274	4279	0 %	50 %	0 %	50 %	229583580
107	NC_012632	TC	3	6	4310	4315	0 %	50 %	0 %	50 %	229583580
108	NC_012632	CCTCTG	2	12	4501	4512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	229583580
109	NC_012632	CTGTG	2	10	4517	4526	0 %	40 %	40 %	20 %	229583580
110	NC_012632	AAG	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583580
111	NC_012632	CCA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583580
112	NC_012632	GTAAT	2	10	4663	4672	40 %	40 %	20 %	0 %	229583580
113	NC_012632	AAT	2	6	4705	4710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583580
114	NC_012632	GTTTT	2	10	4737	4746	0 %	80 %	20 %	0 %	229583580
115	NC_012632	TC	3	6	4780	4785	0 %	50 %	0 %	50 %	229583580
116	NC_012632	AGG	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583580
117	NC_012632	TCT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583581
118	NC_012632	TACG	2	8	4985	4992	25 %	25 %	25 %	25 %	229583581
119	NC_012632	TA	3	6	4999	5004	50 %	50 %	0 %	0 %	229583581
120	NC_012632	ATTGAT	2	12	5009	5020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229583581
121	NC_012632	CTT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583581
122	NC_012632	TAA	2	6	5051	5056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583581
123	NC_012632	CTAAA	2	10	5080	5089	60 %	20 %	0 %	20 %	229583581
124	NC_012632	CCT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583581
125	NC_012632	CAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583581
126	NC_012632	CTTAT	2	10	5286	5295	20 %	60 %	0 %	20 %	229583581
127	NC_012632	AT	3	6	5294	5299	50 %	50 %	0 %	0 %	229583581
128	NC_012632	TCT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583581
129	NC_012632	TAGTCT	2	12	5320	5331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229583581
130	NC_012632	TAAA	2	8	5363	5370	75 %	25 %	0 %	0 %	229583581
131	NC_012632	ATC	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583581
132	NC_012632	TAA	2	6	5591	5596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583581
133	NC_012632	AT	3	6	5668	5673	50 %	50 %	0 %	0 %	229583581
134	NC_012632	TCA	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
135	NC_012632	TC	3	6	6320	6325	0 %	50 %	0 %	50 %	229583582
136	NC_012632	ATC	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
137	NC_012632	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583582
138	NC_012632	GTT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583582
139	NC_012632	GAA	2	6	6455	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583582
140	NC_012632	TAT	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583582
141	NC_012632	TCT	2	6	6499	6504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583582
142	NC_012632	TCT	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583582
143	NC_012632	TCT	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583582
144	NC_012632	TGT	2	6	6728	6733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583582
145	NC_012632	TTTTC	2	10	6765	6774	0 %	80 %	0 %	20 %	229583582
146	NC_012632	T	6	6	6794	6799	0 %	100 %	0 %	0 %	229583582
147	NC_012632	TCA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
148	NC_012632	TAATT	2	10	6852	6861	40 %	60 %	0 %	0 %	229583582
149	NC_012632	ATCT	2	8	6870	6877	25 %	50 %	0 %	25 %	229583582
150	NC_012632	TA	3	6	6957	6962	50 %	50 %	0 %	0 %	229583582
151	NC_012632	CTA	2	6	6989	6994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583582
152	NC_012632	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583582
153	NC_012632	GTA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583583
154	NC_012632	TCTTA	2	10	7160	7169	20 %	60 %	0 %	20 %	229583583
155	NC_012632	TC	3	6	7201	7206	0 %	50 %	0 %	50 %	229583583
156	NC_012632	TCC	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583583
157	NC_012632	CTT	2	6	7219	7224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583583
158	NC_012632	TGG	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583583
159	NC_012632	TTC	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583583
160	NC_012632	T	6	6	7310	7315	0 %	100 %	0 %	0 %	229583583
161	NC_012632	CTG	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583583
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163	NC_012632	CTT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583584
164	NC_012632	CT	3	6	7371	7376	0 %	50 %	0 %	50 %	229583584
165	NC_012632	ACT	3	9	7381	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583584
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168	NC_012632	ATC	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583584
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170	NC_012632	AAC	2	6	7542	7547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583584
171	NC_012632	TAA	2	6	7550	7555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583584
172	NC_012632	TAG	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583584
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183	NC_012632	ATATA	2	10	8215	8224	60 %	40 %	0 %	0 %	229583585
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188	NC_012632	GGT	2	6	8336	8341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583585
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244	NC_012632	ATT	2	6	10886	10891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583587
245	NC_012632	AGTT	2	8	10915	10922	25 %	50 %	25 %	0 %	229583587
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248	NC_012632	TAT	2	6	11107	11112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583588
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251	NC_012632	TAT	2	6	11353	11358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583588
252	NC_012632	TCT	2	6	11412	11417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583588
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254	NC_012632	TCT	2	6	11435	11440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583588
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256	NC_012632	ATTT	2	8	11502	11509	25 %	75 %	0 %	0 %	229583588
257	NC_012632	TCT	3	9	11520	11528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583588
258	NC_012632	ATC	2	6	11591	11596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583588
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262	NC_012632	TC	3	6	11744	11749	0 %	50 %	0 %	50 %	229583589
263	NC_012632	ATT	2	6	11816	11821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583589
264	NC_012632	CTTA	2	8	11837	11844	25 %	50 %	0 %	25 %	229583589
265	NC_012632	ATG	2	6	11845	11850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583589
266	NC_012632	CTA	2	6	11860	11865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583589
267	NC_012632	AAT	2	6	11928	11933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583589
268	NC_012632	GTA	2	6	11970	11975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583589
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270	NC_012632	TCC	2	6	12183	12188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583589
271	NC_012632	TC	3	6	12223	12228	0 %	50 %	0 %	50 %	229583589
272	NC_012632	TAA	2	6	12230	12235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583589
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274	NC_012632	TTC	2	6	12335	12340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583589
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280	NC_012632	TAT	2	6	12592	12597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583589
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282	NC_012632	TA	3	6	12635	12640	50 %	50 %	0 %	0 %	229583589
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287	NC_012632	TAT	2	6	12767	12772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583589
288	NC_012632	ATT	2	6	12776	12781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583589
289	NC_012632	AAGT	2	8	12786	12793	50 %	25 %	25 %	0 %	229583589
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393	NC_012632	AAT	2	6	18413	18418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583593
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395	NC_012632	TA	3	6	18459	18464	50 %	50 %	0 %	0 %	229583593
396	NC_012632	TTC	2	6	18477	18482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583593
397	NC_012632	TCT	2	6	18499	18504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583593
398	NC_012632	TGG	2	6	18517	18522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583593
399	NC_012632	CAA	2	6	18561	18566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583593
400	NC_012632	T	6	6	18575	18580	0 %	100 %	0 %	0 %	229583593
401	NC_012632	TTC	2	6	18594	18599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583593
402	NC_012632	GTTT	2	8	18651	18658	0 %	75 %	25 %	0 %	229583593
403	NC_012632	TAT	2	6	18675	18680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583593
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410	NC_012632	TGG	2	6	19116	19121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583594
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